綜合辦公室是動物研究所的綜合性管理部門，主要工作職能包括所務綜合協調、日常所務管理、信息宣傳、網絡信息服務、保密管理、科普管理等。
黨群工作部是所黨委、紀委直接領導下的綜合辦事機構，圍繞研究所科研創新中心工作開展黨的組織建設、宣傳教育、創新文化建設、黨風廉政建設和群團、統戰工作
圍繞“四個面向“，在所長辦公會、黨委辦公會、所學術委員會領導下，負責研究所科研戰略規劃的制定、組織實施和過程管理、開展評估與總結，全面提升研究所科技創新實力、競爭力和影響力。
人力資源部致力于為全所職工提供優質高效的服務，為研究所當前和未來可持續發展及職工個人職業發展提供強有力的人力資源保障。
財務資產部主要負責動物研究所財務、資產和大型科研儀器設備開放共享管理。
